История Инуссес неразрывно связана с его стратегическим географическим положением и естественно из-за моря.
В 1566 Инуссес вместе с Хиос перешли в руки османского адмирала Пиял Паша, который позднее подарил остров, как флагман, Пармакзи Паша, чьи наследники посвятили на создание мусульманской религиозной организации (Вакуфи).
Во время греческой революции 1821 года, жители покинули остров, и вернулись лишь после 1827 года. Их возвращение ознаменовало собой начало эксплуатации моря для того, чтобы справиться со сложными экономическими условиями того времени. Предварительные этапы этого развития последовали около 1822 года после разрушения Хиос, когда многие покинули остров Инуссес, скрываясь в освобожденных районах соприкасаясь вплотную с морскими профессиями. Их участие выросло настолько, что придало острову огромное морское значение, сделав его ведущим фактором при транспортировке по морю.
Первое поселение было создано Кардамилитесами и пастухами в первой половине 18 века на месте замка Инуссес, а с начала 19 века дома были построены и на восточном побережье, Мандраки, которое и до сих пор служит только в качестве порта для связи с островом Хиос. Жители впоследствии создавая социальную общину на острове,строя храмы и церкви,добились создание организованного сообщества ,правящее избранными старейшинами. Численность постоянного населения на тот момент составляло около 250 человек.
В годы Крымской войны (1853-1856), когда потребности торговли были большими,Инуссес считался центром морского развития. Тогда большая часть людей занималось парусным судоходством.
В 1864 году ремонт церкви Святого Николая
В 1881 году Инуссес подверглись землетрясению,из-за которого сильно пострадал Хиос.
В ноябре 1912 года, во время Первой Балканской войны, острова были присоединены к Греции , после окончания османского владычества.
В 1914 году во время первого преследования, многие из Малой Азии, в основном из деревень напротив Эритреас, поселились в Инуссес,и жили до их возвращения в 1918-1919 гг на родину своих предков.
Новая волна беженцев, нахлынувшая в регион в августе 1922 года после разрушения Смирны, ознаменовалось значительным числом беженцев из Малой Азии когда-либо поселившихся в Инуссес. Проблема отчуждения частных земель для беженцев стала причиной нарушения отношений с местными жителями, начиная с конца 1920-х годов. Помимо проблем, их присутствие имело важное значение для развития народной культуры острова, стало причиной избежать стагнации и сокращения численности населения. Характерная черта этой эпохи стал рост численности населения до 2500 жителей в 1928 году.
В мае 1941 года немцы оккупировали Инуссес,, вызывая серьезные проблемы пропитания на острове, как это случилось на Хиосе. Улучшение условий пришло позднее из-за заботы богатых Инуссес, живших в Афинах. На протяжении оккупации, Инуссес были переправочной станцией греков и англичан в Чешму, а оттуда на Ближний Восток.
Во время Второй мировой войны, как и в предыдущие противостояния, многие моряки погибли в Инуссес после военных операций на море. Общее количество жителей Инуссес,n утонувших в кораблекрушениях с середины 19 до середины 20-го века было непропорционально большим по отношению к численности населения острова. Доказательство претерпения в то время островм больших бед , является памятник Неизвестному матросу ,который был построен в 1952 году в Инуссес и был первым в Греции.
После освобождения произошла эмиграция в Афины , в поисках работы. Это время ознаменовалось открытием офисов и судоходных компаний от судовладельцев Инуссес. Эмиграции усугубило землетрясение 1949 года.
В 1954 году на острове был создано военно-морское училище, которое помогло сохранить население и остановить его падение к тому времени. Сегодня существование военно-морского училища и усилия, предпринимаемые различными органами для развития острова стремятся продолжать великие морскиетрадиции , сохраняя живой надежду избежать опустошение острова.